舰艇对战在二战风云2中呈现出高度拟真与策略深度相结合的特点。游戏通过3D建模技术还原了二战时期各类舰船的外观与性能参数，包括驱逐舰、巡洋舰、战列舰、航空母舰和潜艇五大类，每类舰船在射程、装甲、机动性等属性上存在显著差异。驱逐舰凭借高航速和隐蔽性擅长侦察与鱼雷突袭，而战列舰则以重装甲和超远射程的火炮成为海战核心火力点。舰船间的克制关系遵循历史逻辑，例如潜艇对大型水面舰艇具备致命威胁，但需依赖驱逐舰的声呐扫描才能有效定位目标。这种基于真实海战原理的设计，要求玩家必须掌握舰种特性才能制定有效战术。
游戏中的海域存在动态天气系统，暴雨会降低能见度影响炮击精度，而风浪则会减缓舰船移动速度。地形要素如岛屿和礁石可作为掩护或阻碍，合理利用这些因素能实现以少胜多。舰艇编队需考虑阵型排列，密集阵型利于集中火力但易受鱼雷覆盖，分散阵型可降低被命中率但会削弱输出效率。补给线设计也是关键环节，远离基地的舰艇若燃油或弹药耗尽将丧失战斗力，因此需要规划航线上的临时停靠点。
天赋系统为舰艇作战增添了自定义空间。海上霸主天赋通过降低舰船移动速度换取伤害加成，适合追求火力压制的玩家；深海打击天赋则强化反潜能力，在对抗潜艇集群时更具优势。通用战术卡如加速移动可临时提升航速实现战术机动，护航战舰能强制敌方潜艇攻击指定目标以保护主力舰队。这些天赋与卡牌的搭配使用，使得相同舰种在不同玩家手中可能发挥截然不同的战术价值。
跨海域行动需解决陆军运输效率低下、空军补给困难等问题，通常需要组建包含巡洋舰护航的混合舰队。舰船在远航过程中可能遭遇伏击，因此需提前派遣侦察机或驱逐舰探路。占领敌方港口后需快速重建设施以建立前线补给站，否则远征部队可能因后勤中断而溃败。这种复杂的运营要求玩家具备全局规划能力，不能仅关注局部战斗。
战斗评分系统客观反映战术执行水平。系统会根据舰船损失比、资源消耗效率、目标完成度等数据生成S-A-B-C四级评价，高评分需同时满足低战损与高效推进两项条件。例如千艘战舰对抗百艘敌军时，若战损比超过2:1则难以获得S级。这种机制促使玩家优化战术细节，而非单纯依赖数量优势。部分特殊场景如剿灭帝国海上部队任务中，提前封锁复活点可显著降低战损，但需精确计算驻守兵力与时间窗口。
舰艇对战的策略深度还体现在科技树与军官系统的联动上。舰船改造可提升特定属性，如战列舰的射击精度或航母的舰载机容量，而军官技能则能提供暴击率、损管效率等隐性加成。后期海战实质上是舰队配置、战术选择与实时操作三者结合的综合较量，任何环节的短板都会导致战术失效。这种多维度的策略体系，使得二战风云2的海战模式具有持久的可研究性。
