选择合适的精灵组建队伍是通关的关键。根据游戏机制和实战表现，水箭龟、喷火龙、闪电鸟、超梦、急冻鸟和耿鬼是值得优先培养的强力精灵。这些精灵不仅属性搭配合理，且拥有较高的种族值和实用的技能组合，能够应对二周目更高难度的挑战。
水箭龟作为水属性精灵的代表，具备优秀的防御和特攻能力，能够有效对抗火、地面和岩石属性的对手。喷火龙凭借火与飞行双属性，在对抗草、虫和钢属性精灵时具有天然优势。闪电鸟的电属性攻击能对水系和飞行系造成致命打击，其高速度也保证了先手权。超梦作为超能力系神兽，拥有游戏中最顶尖的特攻种族值，配合丰富的技能池可以应对多种战斗场景。
急冻鸟的冰属性在对抗龙系和地面系时效果显著，其冰冻效果可能改变战局。耿鬼的幽灵与毒双属性组合使其成为特殊攻击手，同时免疫普通和格斗属性攻击。需这些精灵的捕捉位置较为隐蔽，急冻鸟位于双子岛深处，闪电鸟在无人发电厂内部，超梦则藏身于华蓝洞窟最底层，玩家需提前规划探索路线。
水箭龟可学习冲浪、冰冻光束和地震形成多面打击；喷火龙配备喷射火焰、空气斩和龙爪能覆盖更广的克制范围；闪电鸟建议保留十万伏特、钻孔啄和光墙；超梦适合配置精神干扰、阴影球和恢复技能。技能机HM和TM的合理分配能显著提升队伍的整体战斗力。
道具准备方面，建议为主力精灵配备对应属性的增强道具，如神秘水滴、木炭和磁铁等。同时携带足够的超级球和大师球用于捕捉稀有精灵，备足全复药和PP恢复类道具以应对持久战。二周目的对手等级普遍较高，四天王的队伍经过强化，冰系天王科拿的乘龙等级达到66，龙系天王的快龙甚至达到72级，充足的物资储备至关重要。
